NCBI 링크
National Library of Medicine의 NCBI(National Center for Biotechnology Information)에서는 유전 서열 데이터에 대한 여러 데이터베이스를 유지 관리합니다. MEDLINE®의 상세 정보는 10개 데이터베이스에 연결될 수 있습니다. 레코드에 있는 링크를 클릭하여 원본 레코드에 보고된 유전 서열 데이터에 대한 정보를 가져옵니다.
NCBI 데이터베이스에 대한 자세한 내용은 NCBI 웹 사이트를 참조하십시오.
| 데이터베이스 | 설명 |
|---|---|
| Conserved Domains | Conserved Domains는 단백질 도메인의 데이터베이스입니다. Conserved Domains의 원본 데이터베이스는 Pfam, Smart 및 COG.*입니다. |
| Genome 데이터베이스 | Genome 데이터베이스는 다양한 게놈, 완전 염색체, 콘틱과의 서열 지도 및 통합 유전 및 물리 지도에 대한 보기를 제공합니다. 데이터베이스는 6개 주요 생물 그룹인 고세균, 세균, 진핵류, 바이러스, 비로이드 및 플라스미드로 구성되고 초안 게놈 어셈블리는 물론 완전 염색체, 세포 기관 및 플라스미드를 포함합니다.* |
| Nucleotide | Nucleotide 데이터베이스에는 서열 데이터베이스의 3자 구성 국제 공동 작업의 회원인 GenBank, EMBL 및 DDBJ의 서열 데이터가 포함됩니다. EMBL은 영국 Hinxton Hall에 있는 European Molecular Biology Laboratory이고, DDBJ는 일본 Mishima에 있는 DNA Database of Japan입니다. 서열 데이터는 GSDB(Genome Sequence Data Base), Santa Fe, NM에서도 통합됩니다. 특허 서열은 USPTO(U.S. Patent and Trademark Office)와의 협의 및 기타 국제 특허 사무소의 공동 작업 국제 데이터베이스를 통해 통합됩니다.* |
| OIMM 데이터베이스 |
OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)은 Johns Hopkins University 등에서 Dr. Victor A. McKusick과 동료들이 저술 및 편집한 인간 유전자 및 유전병 데이터베이스입니다. 이 데이터베이스는 NCBI에서 World Wide Web용으로 개발되었습니다. 데이터베이스에는 텍스트 정보 및 문헌이 포함됩니다. MEDLINE 및 Entrez system의 서열 레코드에 대한 방대한 링크도 포함됩니다. 또한 NCBI 등에 있는 추가적인 관련 리소스에 대한 링크가 포함됩니다.* |
| PopSet 데이터베이스 | PopSet 데이터베이스에는 모집단, 계통발생 또는 돌연변이 연구의 결과 세트로 제출되는 정렬된 서열이 포함됩니다. 이러한 정렬은 진화 및 모집단 변형과 같은 이벤트를 설명합니다. PopSet 데이터베이스에는 뉴클레오티드 및 단백질 서열 데이터가 둘 다 포함됩니다.* |
| ProbSet | Probe는 시약 배포자, 탐침 유효성 및 계산된 서열 유사성에 대한 정보와 함께 광범위한 생물의학 연구 응용 프로그램에서 사용하도록 설계된 핵산 시약의 공개 레지스트리입니다.* |
| Protein 데이터베이스 | Protein 데이터베이스에는 PIR(Protein Information Resource), SWISS-PROT, PRF(Protein Research Foundation) 및 PDB(Protein Data Bank)에 제출된 단백질 서열(해결된 구조의 서열)은 물론 GenBank, EMBL 및 DDBJ에 있는 DNA 서열에서 변환된 코딩 영역의 서열 데이터가 포함됩니다.* |
| SNP | dbSNP(Single Nucleotide Polymorphism Database)는 단일 염기 뉴클레오티드 치환 및 짧은 삽입/결손 다형성에 대한 중앙 리포지토리 데이터베이스입니다.* |
| Structure | Structure 데이터베이스 또는 MMDB(Molecular Modeling Database)에는 결정학적 및 NMR 구조 분석의 실험 데이터가 포함됩니다. MMDB의 데이터는 PDB(Protein Data Bank)에서 가져옵니다. NCBI에는 서지 정보, 서열 데이터베이스 및 NCBI 분류에 교차 연결된 구조 데이터가 있습니다.* |
| Taxonomy 데이터베이스 | Taxonomy 데이터베이스에는 NCBI 유전자 데이터베이스에서 하나 이상의 뉴클레오티드 또는 단백질 서열별로 표시되는 모든 생물 이름이 포함됩니다. |
| UniGene |
UniGene 데이터베이스에는 전사 시퀀스의 유전자 중심 집합체가 있습니다. UniGene은 GenBank 서열을 유전자 중심 집합체의 비중복 세트로 자동으로 분할하기 위한 실험 시스템입니다. 각 UniGene 집합체에는 고유 유전자 및 유전자가 표현된 조직 유형, 지도 위치 등의 관련 정보를 나타내는 서열이 포함됩니다.* |
| UniSTS |
UniSTS 데이터베이스에는 STS(Sequence Tagged Site) 매핑 데이터에서 파생된 STS 정보가 있습니다. UniSTS는 다양한 공개 리소스로부터 표지 및 지도작성 데이터를 통합합니다. 데이터소스에는 dbSTS, RHdb, GDB, 다양한 인간 지도 및 다양한 생쥐 지도가 포함됩니다.* |
