Ссылки NCBI
Центр National Center for Biotechnology Information (NCBI) библиотеки National Library of Medicine поддерживает несколько баз данных генетических последовательностей. Полная запись в MEDLINE® может быть связана с любой из десяти баз данных. Щелкните ссылку в записи, чтобы получить информацию о данных генетических последовательностей, указанную в записи источника.
Для получения дополнительной информации о базах данных NCBI перейдите на веб-сайт NCBI.
| База данных | Описание |
|---|---|
| Conserved Domains | Conserved Domains – это база данных областей белка. Исходными базами данных для Conserved Domains являются Pfam, Smart и COG.* |
| База данных Genome | База данных Genome содержит отображения разных геномов, полных хромосом, карт последовательностей с перекрытиями и интегрированных генетических и физических карт. База данных организована в соответствии со следующими шестью основными группами организмов: археи, бактерии, эукариоты, вирусы, вироиды и плазмиды, и включает полные хромосомы, органеллы и плазмиды, а также черновые геномные последовательности.* |
| Nucleotide | База данных Nucleotide содержит данные последовательностей из GenBank, EMBL и DDBJ, трех участников группы международного сотрудничества баз данных последовательностей. EMBL – это Европейская лаборатория по молекулярной биологии в Hinxton Hall, Великобритания; DDBJ – это база данных ДНК Японии в городе Мисима, Япония. Кроме того, данные последовательностей берутся из базы данных Genome Sequence Data Base (GSDB), Санта-Фе, Нью-Мексико. Последовательности из патентов включаются посредством соглашений с Бюро патентов США (USPTO) и благодаря сотрудничеству международных баз данных из других международных патентных бюро.* |
| База данных OIMM |
OMIM (Онлайн-каталог генетических маркеров у человека) – это база данных генов человека и наследственных заболеваний, открытых и скорректированных доктором Виктором А. Мак-Кьюсиком и его коллегами в Университете Джонса Хопкинса и других учреждениях. Она была разработана для Интернета центром NCBI. База данных содержит текстовую информацию и ссылки. Она содержит многочисленные ссылки на MEDLINE и записи последовательностей в системе Entrez. Кроме того, эта база данных содержит ссылки на дополнительные связанные ресурсы центра NCBI и другие.* |
| База данных PopSet | База данных PopSet содержит согласованные последовательности, передаваемые в виде группы, полученной в результате изучения популяции, филогенетики или мутации. Эти согласованные последовательности описывают такие явления, как эволюция и колебание численности. База данных PopSet содержит данные последовательностей нуклеотидов и белков.* |
| ProbSet | Probe – это открытый реестр реагентов полинуклеотидов, используемых в различных биомедицинских исследованиях, включающий информацию о распределителях реагентов, эффективности зондов и вычисленные сходства последовательностей.* |
| База данных Protein | База данных Protein содержит данные последовательностей из транслированных кодирующих областей последовательностей ДНК в GenBank, EMBL в DDBJ, а также последовательности белков, переданные в Информационный белковый ресурс (PIR), SWISS-PROT, Protein Research Foundation (PRF) и Protein Data Bank (PDB) (последовательности из разрешенных структур).* |
| SNP | База данных однонуклеотидных полиморфизмов (dbSNP) – это центральное хранилище базы данных для одноосновных нуклеотидных замен, а также делеционных и инсерционных полиморфизмов коротких последовательностей.* |
| Structure | База данных Structure или Molecular Modeling Database (MMDB) содержит экспериментальные данные из кристаллографических определений структуры и определений структуры NMR. Данные для MMDB берутся из Protein Data Bank (PDB). NCBI имеет структурные данные с перекрестными ссылками на библиографическую информацию, на базы данных последовательностей и на таксономические данные NCBI.* |
| База данных Taxonomy | База данных Taxonomy содержит названия всех организмов, представленных в базе генетических данных NCBI хотя бы одним нуклеотидом или одной последовательностью белков.* |
| UniGene |
База данных UniGene содержит генно-ориентированные кластеры последовательностей транскриптов. UniGene – это экспериментальная система для автоматического разбиения последовательностей GenBank по неизбыточным группам генно-ориентированных кластеров. Каждый кластер UniGene содержит последовательности, представляющие уникальный ген, а также связанную информацию, например, типы тканей, в которых был выражен ген, и положение в карте.* |
| UniSTS |
База данных UniSTS содержит ДНК-маркирующие сайты (STS), полученные из данных карт STS. UniSTS объединяет данные маркеров и карт из разных открытых ресурсов. Источники данных включают dbSTS, RHdb, GDB, карты разных людей и карты разных мышей.* |
