NCBI 链接

National Library of Medicine(美国国家医学图书馆)下属的 National Center for Biotechnology Information(美国国家生物技术信息中心,NCBI)维护多个基因序列的数据库。MEDLINE® 的全记录可以链接到这十个数据库中的任意一个数据库。单击记录中的链接可获取有关来源记录中报告的基因序列的信息。

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数据库 说明
保守结构域 Conserved Domains 是蛋白质保守区域数据库。Conserved Domains 的来源数据库是 Pfam、Smart 和 COG。*
Genome 数据库 Genome 数据库供查看各种基因组、完整染色体、带重叠群的序列图谱、集成基因及物理图谱。该数据库分成六个主要生物组:古生菌、细菌、真核生物、病毒、类病毒和质粒,并包括完整的染色体、细胞器和质粒以及基因组序列草图。*
Nucleotide Nucleotide 数据库包含进行国际协作的三个序列数据库 GenBank、EMBL 和 DDBJ 中的序列数据。EMBL 是位于英国 Hinxton Hall 的欧洲分子生物实验室;DDBJ 是位于日本三岛的日本 DNA 数据库。另外还合并了新墨西哥州圣达菲的基因组序列数据库 (GSDB) 中的序列。专利序列是通过美国专利与商标局 (USPTO) 的安排并通过其他国际专利局的协作国际数据库而合并的。*
OIMM 数据库

OMIM(人类孟德尔遗传在线数据库)是由 Victor A. McKusick 博士及其同事在约翰斯霍普金斯大学和其他地方创作和编辑的人类基因和遗传疾病数据库。它由 NCBI 针对万维网而开发。

此数据库包含文本信息和参考文献。它包含指向 MEDLINE 和 Entrez 系统中的序列记录的大量链接,还包含指向 NCBI 和其他位置的其他相关资源的链接。*

PopSet 数据库 PopSet 数据库包含来自群体研究、种系演化研究或突变研究的比对序列。这些比对序列解释了进化和群体变异这样的事件。PopSet 数据库包含核苷酸和蛋白质序列。*
ProbSet Probe 是广泛用于各种生物医学研究应用的核酸试剂公开记录,其中还包括有关试剂分布、探针效用和序列相似性的信息。*
Protein 数据库 Protein 数据库包含从 GenBank、EMBL 和 DDBJ 的 DNA 序列转译而来的编码区中的序列数据,以及提交到蛋白质信息资源 (PIR)、SWISS-PROT、蛋白质研究基金会 (PRF) 和 Protein Data Bank (PDB)的蛋白质序列(已解决结构中的序列)。*
SNP Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) 是有关单核苷酸多态性的数据库,用来查询单个核苷酸替换、缺失、插入引起的序列多态性。*
Structure Structure 数据库或分子建模数据库 (MMDB) 包含从晶体学和 NMR 结构判定获得的实验数据。MMDB 的数据是从 Protein Data Bank (PDB) 中获得的。NCBI 在结构数据与题录信息、序列数据库和 NCBI 分类之间建立了交叉链接。*
Taxonomy 数据库 Taxonomy 数据库包含由 NCBI 基因数据库中的核苷酸序列或蛋白质序列所对应的所有生物的名称。*
UniGene

UniGene 数据库包含基因来源的转录序列簇。

UniGene 是一个实验系统,用于将 GenBank 序列自动分成一系列非冗余的基因来源的簇。每个 UniGene 簇包含表示唯一基因的序列,以及与之相关的组织类型、图谱位置等相关信息。*

UniSTS

UniSTS 数据库包含从 STS 图谱数据派生的序列标记位点 (STS)。

UniSTS 将来自大量公开资源的标记物和图谱数据集成在一起。数据源包括 dbSTS、RHdb、GDB、各种人类图谱以及各种小鼠图谱。*