NCBI 連結
National Library of Medicine 的 National Center for Biotechnology Information (NCBI) 維護多個基因序列資料的資料庫。MEDLINE® 中的完整記錄可連結至十個資料庫之中的任何一個。按一下記錄中的連結可取得來源記錄中提及之基因序列資料的相關資訊。
如需 NCBI 資料庫的詳細資訊,請造訪 NCBI 網站。
資料庫 | 說明 |
---|---|
Conserved Domains | Conserved Domains 是蛋白質功能域的資料庫。Conserved Domains 的來源資料庫是 Pfam、Smart 和 COG。* |
Genome 資料庫 | Genome 資料庫提供基因體、完整染色體、contig 序列圖譜、以及整合的遺傳和物理圖譜的各種檢視。資料庫依六大生物分類組織:古菌、細菌、真核生物、病毒、類病毒、質體,並包含完整染色體、胞器、質體以及基因體組序草稿。* |
Nucleotide | Nucleotide 資料庫包含來自 GenBank、EMBL、DDBJ 的序列資料、前述三者的成員、序列資料庫的國際合作。EMBL 是 European Molecular Biology Laboratory (歐洲分子生物學實驗室),位於英國 Hinxton Hall;DDBJ 是 DNA Database of Japan (日本基因庫),位於日本 Mishima。序列資料也與位於美國新墨西哥州 Santa Fe 的 Genome Sequence Data Base (GSDB) 合作。專利序列則與 USPTO (U.S. Patent and Trademark Office,美國專利商標局) 以及與其他國際專利機構的國際資料庫合作。* |
OIMM 資料庫 | OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) 是人類遺傳與遺傳性疾病的資料庫,由 Johns Hopkins University 的 Dr. Victor A. McKusick 及其同事共同編撰。由 NCBI 發展為網路版。 資料庫上有本文資訊和參考文獻。其中包含大量連結,連至 MEDLINE 和 Entrez 系統中的序列記錄。也包含 NCBI 其他相關資源的連結以及其他連結。* |
PopSet 資料庫 | PopSet 資料庫有依族群、演化或突變研究的結果集提交的比對序列。這些比對描述演化和族群變異一類的事件。PopSet 資料庫中有核苷酸和蛋白質的序列資料。* |
ProbSet | Probe 是公開登錄庫,存放用於各式各樣生醫研究應用的核酸試劑,也提供試劑經銷商資訊、探頭效率、計算的序列相似性。* |
Protein 資料庫 | Protein 資料庫包含 GenBank、EMBL、DDBJ 中 DNA 序列的轉譯編碼區段的序列資料,以及提交至 Protein Information Resource (PIR)、SWISS-PROT、Protein Research Foundation (PRF)、Protein Data Bank (PDB) 的蛋白質序列 (解出之結構的序列)。* |
SNP | Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) 是單鹼基核苷酸取代以及短臂刪除和插入多形性的集中 Repository 資料庫。* |
Structure | Structure 資料庫又稱為 Molecular Modeling Database (MMDB),包含結晶和 NMR 結構測定的實驗資料。MMDB 的資料取自 Protein Data Bank (PDB)。NCBI 已將結構資料交叉連結至書目資訊、序列資料庫和 NCBI 分類。* |
Taxonomy 資料庫 | Taxonomy (分類) 資料庫包含 NCBI 基因資料庫中至少呈現一個核苷酸或蛋白質序列的所有生物的名稱。* |
UniGene | UniGene 資料庫包含轉錄序列的基因導向基因串。 UniGene 是實驗性系統,將 GenBank 序列自動分割為基因導向基因串的非多餘序列集。每個 UniGene 基因串包含的序列代表獨一無二的基因以及相關的資訊,如基因表現的組織種類、圖譜位置。* |
UniSTS | UniSTS 資料庫包含由 STS 定位資料衍生的 Sequence Tagged Site (序列標誌點,STS)。 UniSTS 整合各式各樣公開資源上的標記及定位資料。資料來源包括 dbSTS、RHdb、GDB、各種人類圖譜和各種老鼠圖譜。* |